吗啡的结构式为HO-O-HO-H-N。可待因的结构式为CH3-O-O-H-OH-H-N-CH3。
吗啡分子中存在酚羟基，而可待因分子中的酚羟基已转化为醚键。因为，酚可与中性三氯化铁反应显蓝紫色，而醚在同样条件下却不反应。但醚在浓硫酸存在下，加热，醚键可断裂重新生成酚羟基，生成的酚羟基可与三氯化铁反应显蓝紫色。
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