税率为3%的增值税发票不可以抵扣。小规模纳税人增值税征收率为3%，国务院另有规定的除外。小规模纳税人发生应税销售行为，实行按照销售额和征收率计算应纳税额的简易办法，并不得抵扣进项税额。
《中华人民共和国增值税暂行条例》第十一条 小规模纳税人发生应税销售行为，实行按照销售额和征收率计算应纳税额的简易办法，并不得抵扣进项税额。应纳税额计算公式： 应纳税额=销售额×征收率 规模纳税人的标准由国务院财政、税务主管部门规定。 《中华人民共和国增值税暂行条例》第十二条 小规模纳税人增值税征收率为3%，国务院另有规定的除外。 《中华人民共和国增值税暂行条例》第十三条 小规模纳税人以外的纳税人应当向主管税务机关办理登记。具体登记办法由国务院税务主管部门制定。 小规模纳税人会计核算健全，能够提供准确税务资料的，可以向主管税务机关办理登记，不作为小规模纳税人，依照本条例有关规定计算应纳税额。