钻石生成于大自然，所以有瑕疵是正常的，现在已经不称之为瑕疵而是称之为内含物了，主要有：针状物、云状物、羽裂纹、矿物包体、生长纹、天然晶面抛光纹等。钻石瑕疵直接影响到钻石的净度，钻石瑕疵的分布也代表着钻石净度等级的划分。具体视等级的划分而定。
钻石瑕疵净度等级对照
FL指在10倍宝石放大镜下观察钻石洁净，即宝石内部和外部均不见内含物。
IF指在10倍宝石放大镜下观察钻石内部无任何瑕疵，但表面或许有一点点瑕疵，重新抛光即可除去。
VVS指在10倍宝石放大镜下观察钻石可见到亭部或表面有极小的瑕疵。VVS1和VVS2的区别是后者有极微小的棉状点和小毛茬等。
VS指在10倍宝石放大镜下观察钻石可见非常微小的瑕疵。VS1和VS2的区别在于后者可能有微小的棉状点或小毛茬。
SI分为SI1和SI2两级，显著的瑕疵，钻石分级师在10倍放大镜下易见。SI2的钻石从亭部一侧观察时，肉眼可见包裹体。
I1、I2、I3指在10倍宝石放大镜下观察钻石易于见到小瑕疵，肉眼刚刚能够看见到肉眼易见，个别有明显的解理和裂隙。