夫妻双方可协商小产权房的分割和财产补充，一致约定在离婚协议中。如无法协商，可起诉法院分割。但由于国家登记规定和限购政策的影响，双方难协商，法院难直接分割。有些法院会要求另案起诉或先处理使用权。等产权完备后再分割。
法律分析
对于小产权房的分割，夫妻双方可以协商归属及对未获得所有权一方的财产进行补偿。若协商不成，可起诉至法院要求分割。由于小产权房的分割涉及国家的房产登记规定和各地的房产限购政策，双方较难就归属价款股问题协商一致，法院也难以直接分割。有些法院选择另案起诉，不在离婚案件中处理，而有些法院则会先处理房屋的使用权，并告知当事人等产权完备后再进行分割。
法律依据
《民法典》第一千零八十七条
离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理；
协议不成的，由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。对夫或者妻在家庭土地承包经营中享有的权益等，应当依法予以保护。 该内容由 杨岚律师 和 家和律云 共创回答