来源不同：纯净水通过电渗析器法，离子交换器法，反渗透法，蒸馏法及其他适当的加工方法制得而成，使水中的离子发生迁移，从而去除水中的离子杂质。离子交换器法是利用离子交换树脂，将水中的离子与树脂上的离子进行交换，从而去除水中的离子杂质，天然水是地球表面水循环的一部分，来源于江河、海洋、冰川等，江河的水来源于降水，经过地表的流动，携带了大量的溶解固体，有机物和微生物。性质不同：纯净水指的是不含杂质的水，简称净水或纯水，是纯洁，干净，不含有杂质或细菌的水，如有机污染物、无机盐、任何添加剂和各类杂质，是以符合生活饮用水卫生标准的水为原水，天然水构成自然界地球表面各种形态水的总称，包括江河。海洋，冰川，湖泊，沼泽等地表水以及土壤，岩石层内的地下水等天然水体。
